No ano de 2010, o Sacro Império da Britânia está se estabelecendo como uma nação militar dominante, começando com a conquista do Japão. Renomeado para Área 11 após a sua rápida derrota, o Japão tem visto uma resistência significativa contra estes tiranos numa tentativa de recuperar a independência.

Lelouch Lamperouge, um estudante britânico, infelizmente se vê preso em um fogo cruzado entre as forças armadas rebeldes britânicas e da Área 11. Ele consegue escapar, no entanto, graças ao aparecimento oportuno de uma garota misteriosa chamada C.C., que lhe concede Geass, o "Poder dos Reis". Percebendo o vasto potencial de seu recém-descoberto “poder de obediência absoluta”, Lelouch embarca em uma jornada perigosa como o vigilante mascarado conhecido como Zero, liderando um ataque impiedoso contra Britannia para se vingar de uma vez por todas.