Renton, filho de cientistas, e Eureka, uma menina que não consegue viver sob o sol, são criados juntos desde muito jovens e tornam-se muito apegados um ao outro. Um dia, Eureka é levada embora. Impotente no momento, Renton promete resgatá-la. Ele entra no exército e logo é designado para a Unidade de Jovens Independentes 303 das Primeiras Forças Móveis, graças ao seu desempenho excepcional ao lado de seu Nirvash, um sistema de controle/armadura biomecânico. Desconhecido para Renton, existe um plano para extinguir a invasão alienígena que está acontecendo atualmente, envolvendo não apenas ele, mas também Eureka.