Os Reinos de Dolhr, Grust e Gra se unem para travar uma guerra no resto do continente Archanea e derrotar o Reino de Altea. O rei Cornelius é morto em batalha, mas seu filho, o príncipe Marth, consegue escapar da invasão graças ao sacrifício de sua irmã mais velha, Elice. Ele e um pequeno grupo de retentores encontram refúgio na ilha-nação de Talys, onde passam os próximos três anos escondidos sob a proteção da família real.

Marth vive uma vida pacífica em Talys, apreciando a beleza da ilha e a amizade de sua princesa que monta um pégaso, Caeda. Mas ele está inquieto, sabendo que em breve chegará o dia em que deverá pegar em armas. Esse dia chega quando Caeda chega em pânico até Marth e seus servos, dizendo-lhe que a cidade do castelo foi atacada. Depois de alguns apuros, eles conseguem derrotar os agressores e salvar a cidade.

Percebendo que sua presença pode trazer ainda mais perigo ao seu novo lar, Marth decide que agora é a hora de partir. Ele viaja para formar um exército para recuperar seu reino.