Kazuya Kujou é uma estudante estrangeira na Saint Marguerite Academy, um luxuoso internato em Sauville, país do sul da Europa. Originário do Japão, seu cabelo preto e olhos castanhos escuros fazem com que seus colegas o evitem e lhe dêem o apelido de "Ceifador Negro", baseado em uma lenda urbana popular sobre o viajante que traz a morte na primavera.

Num dia como qualquer outro, Kujou visita a extravagante biblioteca da escola em busca de histórias de fantasmas. Porém, seu foco logo muda quando ele fica curioso sobre uma mecha de cabelo dourada na escada. Os degraus o levam a um grande jardim e a uma linda menina parecida com uma boneca conhecida como Victorique de Blois, cuja visão complexa e imaginativa lhe permite prever seus futuros, agora interligados.

Com mais mistérios se desenvolvendo rapidamente – incluindo o aparecimento de um navio fantasma e um alquimista com o poder de transmutação – Victorique e Kujou, ligados pelo destino e por suas habilidades únicas, não têm escolha a não ser confiar um no outro.