No ano 2311 DC, um mundo que antes se via cheio de conflitos intercontinentais agora está unificado, liderado pela Federação da Esfera Terrestre (ESF). A ESF estabeleceu uma força-tarefa militar preventiva conhecida como A-Laws, incumbindo-os de encerrar organizações terroristas violentas. À medida que ganham cada vez mais autoridade legal, os A-Laws começam a distorcer a lei para se adequar à sua própria agenda, governando os cidadãos da Terra com mão pesada.

Em resposta ao comportamento fascista dos A-Laws, o grupo antiterrorista Celestial Being reaparece. Liderados por mobile suit de última geração conhecidos como Gundam, os pilotos do Celestial Being travam uma nova guerra com os A-Laws, com o objetivo de impedir seu tirânico abuso de poder.

Setsuna F. Seiei, piloto do Gundam Exia, ajuda a liderar o ataque junto com seus companheiros Gundam Meisters Lockon Stratos, Allelujah Haptism e Tieria Erde. Mas no processo, Setsuna se depara com uma trama conspiratória liderada por uma nova facção, os Inovadores, e deve enfrentar suas próprias velhas feridas e fantasmas do passado para salvar um mundo que o despreza.