Dois anos se passaram desde o fim do “Sucessor Marciano Nadesico”. Akito e Yurika desapareceram. Os Jovianos e os Terráqueos uniram forças e Ruri é agora capitão do Nadesico B. À medida que a popularidade do Boson Jumping cresce, uma vasta rede de transporte foi desenvolvida. Apelidada de Plano Hisago, esta rede de portais Chulip contém as respostas para os mistérios por trás das partículas Bose e seu poder. Se esses segredos caíssem em mãos erradas, isso poderia significar grandes problemas. E há um grande problema. Um grupo dissidente marciano lançou uma ofensiva, deixando as Forças Unidas confusas e desesperadas. Tanto é assim, de facto, que a antiga tripulação do Nadesico é chamada de volta ao serviço activo para uma missão especial não autorizada: salvar-nos a todos. Esse zoológico de desajustados tem o que é preciso? Quem vencerá a corrida pela tecnologia Boson? E o que diabos aconteceu com Akito e Yurika?