Um tanto baseado na história real de como a Gainax foi fundada, Otaku no Video aborda todos os aspectos de um estilo de vida otaku. Takeshi Kubo é um jovem que leva uma vida normal até ser arrastado para um grupo de otaku. Lentamente, ele se torna mais parecido com eles até decidir abandonar sua vida anterior para se tornar o rei dos otaku – os otake!

Misturadas estão entrevistas live-action com otakus reais, abordando todos os aspectos da vida hardcore dos otakus. Não estão incluídos apenas fãs de anime e mangá, mas também fãs de ficção científica, fãs militares e outros grupos de geeks japoneses.