O excêntrico cientista Rintarou Okabe tem uma sede inesgotável de exploração científica. Junto com sua amiga estúpida, mas bem-intencionada, Mayuri Shiina e seu colega de quarto Itaru Hashida, Okabe funda o Future Gadget Laboratory na esperança de criar inovações tecnológicas que confundam a psique humana. Apesar das alegações de grandeza, o único “aparelho” notável que o trio criou é um micro-ondas que tem o poder misterioso de transformar bananas em gosma verde.

No entanto, quando Okabe participa de uma conferência sobre viagem no tempo, ele vivencia uma série de eventos estranhos que o levam a acreditar que há mais no gadget "Telefone Microondas" do que aparenta. Aparentemente capaz de enviar mensagens de texto para o passado usando o micro-ondas, Okabe se envolve ainda mais com a “máquina do tempo”, atraindo a ira e a atenção da misteriosa organização SERN.

Devido à nova descoberta, Okabe e seus amigos se encontram em um perigo sempre presente. Enquanto trabalha para mitigar os danos que sua invenção causou à linha do tempo, Okabe trava uma batalha não apenas para salvar seus entes queridos, mas também para preservar sua degradante sanidade.

[Escrito por MAL Rewrite]